В программе марафона было две дистанции: 42.195 км и 10 км. Трасса марафона была проложена одним кольцом по центральной части города — марафонцы бежали мимо Исаакиевского собора, Медного всадника, стрелки Васильевского острова, Петропавловской крепости и т.д. По количеству финишировавших на основной дистанции (42 км 195 м) марафон занимает первое место в России. В 2012 году на дистанции 42 км 195 м стартовало около 1 тысячи 300 спортсменов, дистанцию закончили — 1 тысяча 170.